Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSD3Q9NYI0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSD3Q9NYI0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms