Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKN2AIPQ9NXV6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms