Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKS1Q9NXB0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKS1Q9NXB0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKS1Q9NXB0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms