Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CMTM6Q9NX76 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMTM6Q9NX76 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms