Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL11Q9NVR0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms