Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMBRD1Q9NUN5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMBRD1Q9NUN5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBRD1Q9NUN5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms