Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A9Q9NUM3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms