Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms