Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRAC1Q9NRG0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CHRAC1Q9NRG0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRAC1Q9NRG0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms