Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE3Q9NRF9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms