Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH2B1Q9NRF2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms