Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHST12Q9NRB3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHST12Q9NRB3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms