Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPHK2Q9NRA0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPHK2Q9NRA0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms