Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MRPL40Q9NQ50 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms