Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNK9Q9NPC2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNK9Q9NPC2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms