Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB6Q9NP58 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCB6Q9NP58 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms