Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CLSPNQ9HAW4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CLSPNQ9HAW4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLSPNQ9HAW4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms