Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG4Q9H9E3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COG4Q9H9E3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms