Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
WDR55Q9H6Y2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR55Q9H6Y2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR55Q9H6Y2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms