Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SENP3Q9H4L4 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SENP3Q9H4L4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SENP3Q9H4L4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms