Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOC1Q9H4F8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOC1Q9H4F8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms