Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00597Q9H2U6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms