Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
EHD4Q9H223 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EHD4Q9H223 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms