Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM49AQ9H0Q0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM49AQ9H0Q0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM49AQ9H0Q0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM49AQ9H0Q0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM49AQ9H0Q0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM49AQ9H0Q0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms