Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRTNQ9H040 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRTNQ9H040 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms