Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MCOLN1Q9GZU1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCOLN1Q9GZU1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCOLN1Q9GZU1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCOLN1Q9GZU1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms