Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIF3L1Q9GZT8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NIF3L1Q9GZT8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NIF3L1Q9GZT8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms