Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL4Q9C0H6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms