Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM4Q9C037 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM4Q9C037 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM4Q9C037 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms