Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM6Q9C030 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM6Q9C030 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms