Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX2

TBC1D2, TBC1 domain family member 2A, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D2Q9BYX2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TBC1D2Q9BYX2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TBC1D2Q9BYX2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBC1D2Q9BYX2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TBC1D2Q9BYX2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBC1D2Q9BYX2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBC1D2Q9BYX2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBC1D2Q9BYX2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBC1D2Q9BYX2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TBC1D2Q9BYX2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TBC1D2Q9BYX2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TBC1D2Q9BYX2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBC1D2Q9BYX2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms