Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP1-5Q9BYS1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-5Q9BYS1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-5Q9BYS1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-5Q9BYS1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-5Q9BYS1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-5Q9BYS1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-5Q9BYS1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-5Q9BYS1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-5Q9BYS1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-5Q9BYS1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-5Q9BYS1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP1-5Q9BYS1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP1-5Q9BYS1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP1-5Q9BYS1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms