Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CADM1Q9BY67 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CADM1Q9BY67 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM1Q9BY67 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM1Q9BY67 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms