Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC46A2Q9BY10 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC46A2Q9BY10 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms