Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW7

SCRT1, Transcriptional repressor scratch 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT1Q9BWW7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCRT1Q9BWW7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRT1Q9BWW7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms