Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWQ6

YIPF2, Protein YIPF2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF2Q9BWQ6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF2Q9BWQ6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms