Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIGD2AQ9BW72 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIGD2AQ9BW72 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIGD2AQ9BW72 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIGD2AQ9BW72 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIGD2AQ9BW72 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HIGD2AQ9BW72 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HIGD2AQ9BW72 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HIGD2AQ9BW72 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HIGD2AQ9BW72 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HIGD2AQ9BW72 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms