Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG8

KIFC3, Kinesin-like protein KIFC3, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3Q9BVG8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIFC3Q9BVG8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KIFC3Q9BVG8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms