Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM43Q9BTV4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM43Q9BTV4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms