Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PI4K2AQ9BTU6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PI4K2AQ9BTU6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PI4K2AQ9BTU6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms