Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCMBPQ9BTE3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCMBPQ9BTE3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCMBPQ9BTE3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.6 ms