Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SHANK2-AS3Q9BTD1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms