Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTA3Q9BTC8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms