Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS4Q9BT78 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS4Q9BT78 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS4Q9BT78 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS4Q9BT78 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS4Q9BT78 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS4Q9BT78 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS4Q9BT78 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS4Q9BT78 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS4Q9BT78 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS4Q9BT78 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS4Q9BT78 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS4Q9BT78 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS4Q9BT78 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPS4Q9BT78 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COPS4Q9BT78 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms