Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCM2Q9BSQ5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms