Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM56Q9BRZ2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM56Q9BRZ2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM56Q9BRZ2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms