Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP23Q9BRU9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms