Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM246Q9BRR3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms