Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM1Q9BR11 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZSWIM1Q9BR11 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms