Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPIN3Q9BQK8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LPIN3Q9BQK8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms